百周年校園將於前水務署配水庫上興建。香港大學耗資5億港元為水務署進行重置水庫工程。工程於2007年初展開，並如期於本年九月中完工。工程包括挖掘隧道以儲存鹹水、新建兩個淡水配水庫、新建緊急車輛通道及集管廊。

在水庫重置工程完成後，百周年校園上蓋工程隨即於九月中開始。工程合約由金門建築有限公司奪得，造價為19.7億港元。工程預計於2012年3月完成。